Protein–RNA interactions for Protein: Q02257

Jup, Junction plakoglobin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JupQ02257 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
JupQ02257 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
JupQ02257 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
JupQ02257 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
JupQ02257 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
JupQ02257 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
JupQ02257 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
JupQ02257 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
JupQ02257 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
JupQ02257 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
JupQ02257 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
JupQ02257 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
JupQ02257 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
JupQ02257 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
JupQ02257 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
JupQ02257 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
JupQ02257 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
JupQ02257 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
JupQ02257 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
JupQ02257 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
JupQ02257 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
JupQ02257 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
JupQ02257 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
JupQ02257 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
JupQ02257 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
JupQ02257 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
JupQ02257 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
JupQ02257 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
JupQ02257 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
JupQ02257 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JupQ02257 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JupQ02257 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JupQ02257 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
JupQ02257 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JupQ02257 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JupQ02257 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JupQ02257 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JupQ02257 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JupQ02257 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
JupQ02257 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
JupQ02257 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JupQ02257 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JupQ02257 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
JupQ02257 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
JupQ02257 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JupQ02257 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JupQ02257 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JupQ02257 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JupQ02257 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JupQ02257 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JupQ02257 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
JupQ02257 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
JupQ02257 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JupQ02257 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JupQ02257 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JupQ02257 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JupQ02257 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
JupQ02257 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
JupQ02257 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
JupQ02257 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
JupQ02257 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
JupQ02257 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
JupQ02257 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
JupQ02257 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
JupQ02257 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
JupQ02257 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
JupQ02257 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
JupQ02257 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
JupQ02257 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
JupQ02257 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
JupQ02257 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
JupQ02257 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
JupQ02257 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
JupQ02257 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
JupQ02257 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
JupQ02257 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
JupQ02257 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
JupQ02257 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
JupQ02257 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
JupQ02257 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
JupQ02257 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
JupQ02257 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
JupQ02257 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
JupQ02257 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
JupQ02257 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
JupQ02257 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
JupQ02257 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
JupQ02257 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
JupQ02257 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
JupQ02257 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
JupQ02257 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
JupQ02257 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
JupQ02257 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
JupQ02257 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
JupQ02257 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
JupQ02257 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
JupQ02257 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
JupQ02257 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
JupQ02257 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
JupQ02257 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms