Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PrkcqQ02111 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PrkcqQ02111 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkcqQ02111 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkcqQ02111 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkcqQ02111 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkcqQ02111 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkcqQ02111 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkcqQ02111 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkcqQ02111 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkcqQ02111 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkcqQ02111 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PrkcqQ02111 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PrkcqQ02111 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PrkcqQ02111 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PrkcqQ02111 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PrkcqQ02111 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PrkcqQ02111 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PrkcqQ02111 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms