Protein–RNA interactions for Protein: Q02053

Uba1, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba1Q02053 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Uba1Q02053 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Uba1Q02053 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Uba1Q02053 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Uba1Q02053 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Uba1Q02053 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Uba1Q02053 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Uba1Q02053 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Uba1Q02053 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Uba1Q02053 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Uba1Q02053 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Uba1Q02053 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Uba1Q02053 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Uba1Q02053 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Uba1Q02053 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Uba1Q02053 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Uba1Q02053 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Uba1Q02053 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Uba1Q02053 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Uba1Q02053 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Uba1Q02053 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Uba1Q02053 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Uba1Q02053 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Uba1Q02053 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Uba1Q02053 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Uba1Q02053 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Uba1Q02053 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Uba1Q02053 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Uba1Q02053 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Uba1Q02053 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Uba1Q02053 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Uba1Q02053 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Uba1Q02053 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Uba1Q02053 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Uba1Q02053 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Uba1Q02053 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Uba1Q02053 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Uba1Q02053 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Uba1Q02053 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Uba1Q02053 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Uba1Q02053 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Uba1Q02053 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Uba1Q02053 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Uba1Q02053 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Uba1Q02053 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Uba1Q02053 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Uba1Q02053 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Uba1Q02053 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Uba1Q02053 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Uba1Q02053 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Uba1Q02053 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Uba1Q02053 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Uba1Q02053 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Uba1Q02053 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Uba1Q02053 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Uba1Q02053 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Uba1Q02053 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Uba1Q02053 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Uba1Q02053 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Uba1Q02053 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Uba1Q02053 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Uba1Q02053 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Uba1Q02053 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Uba1Q02053 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Uba1Q02053 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Uba1Q02053 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Uba1Q02053 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Uba1Q02053 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Uba1Q02053 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20■□□□□ 0.79
Uba1Q02053 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Uba1Q02053 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Uba1Q02053 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Uba1Q02053 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Uba1Q02053 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Uba1Q02053 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Uba1Q02053 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Uba1Q02053 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Uba1Q02053 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Uba1Q02053 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Uba1Q02053 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Uba1Q02053 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Uba1Q02053 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Uba1Q02053 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Uba1Q02053 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Uba1Q02053 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Uba1Q02053 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Uba1Q02053 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Uba1Q02053 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Uba1Q02053 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Uba1Q02053 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Uba1Q02053 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Uba1Q02053 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Uba1Q02053 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Uba1Q02053 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Uba1Q02053 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Uba1Q02053 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Uba1Q02053 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Uba1Q02053 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Uba1Q02053 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Uba1Q02053 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms