Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cacna1cQ01815 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cacna1cQ01815 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cacna1cQ01815 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacna1cQ01815 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacna1cQ01815 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacna1cQ01815 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacna1cQ01815 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacna1cQ01815 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacna1cQ01815 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacna1cQ01815 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacna1cQ01815 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacna1cQ01815 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacna1cQ01815 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacna1cQ01815 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacna1cQ01815 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacna1cQ01815 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacna1cQ01815 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacna1cQ01815 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacna1cQ01815 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacna1cQ01815 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacna1cQ01815 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacna1cQ01815 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacna1cQ01815 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacna1cQ01815 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cacna1cQ01815 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cacna1cQ01815 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cacna1cQ01815 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cacna1cQ01815 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cacna1cQ01815 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cacna1cQ01815 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cacna1cQ01815 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cacna1cQ01815 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cacna1cQ01815 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cacna1cQ01815 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms