Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Top2aQ01320 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Top2aQ01320 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Top2aQ01320 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Top2aQ01320 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Top2aQ01320 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Top2aQ01320 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Top2aQ01320 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Top2aQ01320 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Top2aQ01320 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Top2aQ01320 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Top2aQ01320 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Top2aQ01320 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Top2aQ01320 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Top2aQ01320 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Top2aQ01320 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Top2aQ01320 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Top2aQ01320 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Top2aQ01320 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Top2aQ01320 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Top2aQ01320 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Top2aQ01320 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Top2aQ01320 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Top2aQ01320 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Top2aQ01320 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Top2aQ01320 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Top2aQ01320 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Top2aQ01320 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Top2aQ01320 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Top2aQ01320 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Top2aQ01320 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Top2aQ01320 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Top2aQ01320 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Top2aQ01320 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Top2aQ01320 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Top2aQ01320 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Top2aQ01320 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Top2aQ01320 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Top2aQ01320 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Top2aQ01320 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Top2aQ01320 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Top2aQ01320 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Top2aQ01320 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Top2aQ01320 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Top2aQ01320 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Top2aQ01320 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Top2aQ01320 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Top2aQ01320 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Top2aQ01320 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Top2aQ01320 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Top2aQ01320 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Top2aQ01320 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Top2aQ01320 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Top2aQ01320 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Top2aQ01320 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Top2aQ01320 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC32.07■■■□□ 2.73
Top2aQ01320 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Top2aQ01320 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Top2aQ01320 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Top2aQ01320 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Top2aQ01320 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Top2aQ01320 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Top2aQ01320 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Top2aQ01320 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Top2aQ01320 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Top2aQ01320 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Top2aQ01320 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Top2aQ01320 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Top2aQ01320 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Top2aQ01320 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Top2aQ01320 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Top2aQ01320 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Top2aQ01320 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Top2aQ01320 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Top2aQ01320 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Top2aQ01320 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Top2aQ01320 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Top2aQ01320 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Top2aQ01320 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Top2aQ01320 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Top2aQ01320 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Top2aQ01320 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Top2aQ01320 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Top2aQ01320 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Top2aQ01320 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Top2aQ01320 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Top2aQ01320 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Top2aQ01320 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Top2aQ01320 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Top2aQ01320 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
Top2aQ01320 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
Top2aQ01320 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Top2aQ01320 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Top2aQ01320 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Top2aQ01320 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Top2aQ01320 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
Top2aQ01320 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Top2aQ01320 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Top2aQ01320 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Top2aQ01320 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms