Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col1a2Q01149 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col1a2Q01149 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col1a2Q01149 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col1a2Q01149 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col1a2Q01149 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col1a2Q01149 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col1a2Q01149 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Col1a2Q01149 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col1a2Q01149 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col1a2Q01149 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col1a2Q01149 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Col1a2Q01149 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col1a2Q01149 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col1a2Q01149 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col1a2Q01149 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col1a2Q01149 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col1a2Q01149 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col1a2Q01149 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Col1a2Q01149 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Col1a2Q01149 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Col1a2Q01149 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Col1a2Q01149 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Col1a2Q01149 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Col1a2Q01149 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Col1a2Q01149 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Col1a2Q01149 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Col1a2Q01149 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Col1a2Q01149 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Col1a2Q01149 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Col1a2Q01149 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Col1a2Q01149 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Col1a2Q01149 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Col1a2Q01149 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Col1a2Q01149 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Col1a2Q01149 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Col1a2Q01149 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Col1a2Q01149 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Col1a2Q01149 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Col1a2Q01149 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Col1a2Q01149 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Col1a2Q01149 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Col1a2Q01149 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Col1a2Q01149 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Col1a2Q01149 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Col1a2Q01149 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Col1a2Q01149 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Col1a2Q01149 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Col1a2Q01149 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Col1a2Q01149 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Col1a2Q01149 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Col1a2Q01149 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Col1a2Q01149 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col1a2Q01149 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col1a2Q01149 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col1a2Q01149 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col1a2Q01149 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col1a2Q01149 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col1a2Q01149 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col1a2Q01149 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col1a2Q01149 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col1a2Q01149 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col1a2Q01149 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col1a2Q01149 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col1a2Q01149 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Col1a2Q01149 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Col1a2Q01149 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col1a2Q01149 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col1a2Q01149 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col1a2Q01149 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col1a2Q01149 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Col1a2Q01149 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Col1a2Q01149 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col1a2Q01149 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Col1a2Q01149 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col1a2Q01149 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col1a2Q01149 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col1a2Q01149 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col1a2Q01149 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col1a2Q01149 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col1a2Q01149 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col1a2Q01149 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col1a2Q01149 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col1a2Q01149 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col1a2Q01149 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col1a2Q01149 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col1a2Q01149 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col1a2Q01149 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col1a2Q01149 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col1a2Q01149 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col1a2Q01149 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col1a2Q01149 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Col1a2Q01149 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col1a2Q01149 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col1a2Q01149 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col1a2Q01149 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col1a2Q01149 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col1a2Q01149 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col1a2Q01149 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col1a2Q01149 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms