Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Grin2bQ01097 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Grin2bQ01097 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Grin2bQ01097 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Grin2bQ01097 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
Grin2bQ01097 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Grin2bQ01097 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Grin2bQ01097 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
Grin2bQ01097 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Grin2bQ01097 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Grin2bQ01097 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Grin2bQ01097 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Grin2bQ01097 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Grin2bQ01097 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Grin2bQ01097 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Grin2bQ01097 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Grin2bQ01097 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Grin2bQ01097 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Grin2bQ01097 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Grin2bQ01097 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Grin2bQ01097 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Grin2bQ01097 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Grin2bQ01097 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Grin2bQ01097 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Grin2bQ01097 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Grin2bQ01097 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Grin2bQ01097 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Grin2bQ01097 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Grin2bQ01097 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Grin2bQ01097 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Grin2bQ01097 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Grin2bQ01097 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Grin2bQ01097 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Grin2bQ01097 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Grin2bQ01097 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Grin2bQ01097 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Grin2bQ01097 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Grin2bQ01097 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Grin2bQ01097 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Grin2bQ01097 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Grin2bQ01097 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Grin2bQ01097 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Grin2bQ01097 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Grin2bQ01097 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Grin2bQ01097 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Grin2bQ01097 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Grin2bQ01097 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Grin2bQ01097 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Grin2bQ01097 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Grin2bQ01097 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Grin2bQ01097 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Grin2bQ01097 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Grin2bQ01097 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
Grin2bQ01097 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Grin2bQ01097 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Grin2bQ01097 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Grin2bQ01097 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Grin2bQ01097 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Grin2bQ01097 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Grin2bQ01097 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Grin2bQ01097 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Grin2bQ01097 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Grin2bQ01097 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Grin2bQ01097 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Grin2bQ01097 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Grin2bQ01097 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Grin2bQ01097 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Grin2bQ01097 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Grin2bQ01097 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Grin2bQ01097 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Grin2bQ01097 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Grin2bQ01097 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Grin2bQ01097 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Grin2bQ01097 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Grin2bQ01097 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
Grin2bQ01097 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Grin2bQ01097 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Grin2bQ01097 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Grin2bQ01097 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Grin2bQ01097 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Grin2bQ01097 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Grin2bQ01097 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Grin2bQ01097 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Grin2bQ01097 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Grin2bQ01097 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Grin2bQ01097 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Grin2bQ01097 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Grin2bQ01097 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
Grin2bQ01097 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Grin2bQ01097 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Grin2bQ01097 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Grin2bQ01097 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Grin2bQ01097 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Grin2bQ01097 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
Grin2bQ01097 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Grin2bQ01097 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Grin2bQ01097 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Grin2bQ01097 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Grin2bQ01097 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Grin2bQ01097 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 209.8 ms