Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gjb2Q00977 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gjb2Q00977 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gjb2Q00977 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gjb2Q00977 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gjb2Q00977 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gjb2Q00977 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gjb2Q00977 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gjb2Q00977 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gjb2Q00977 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Gjb2Q00977 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gjb2Q00977 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gjb2Q00977 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gjb2Q00977 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gjb2Q00977 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gjb2Q00977 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gjb2Q00977 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gjb2Q00977 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gjb2Q00977 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gjb2Q00977 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gjb2Q00977 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gjb2Q00977 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gjb2Q00977 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gjb2Q00977 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gjb2Q00977 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gjb2Q00977 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gjb2Q00977 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gjb2Q00977 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gjb2Q00977 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gjb2Q00977 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gjb2Q00977 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gjb2Q00977 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gjb2Q00977 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gjb2Q00977 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gjb2Q00977 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gjb2Q00977 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gjb2Q00977 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gjb2Q00977 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gjb2Q00977 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gjb2Q00977 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gjb2Q00977 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Gjb2Q00977 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gjb2Q00977 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gjb2Q00977 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gjb2Q00977 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gjb2Q00977 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gjb2Q00977 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gjb2Q00977 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gjb2Q00977 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gjb2Q00977 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gjb2Q00977 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gjb2Q00977 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gjb2Q00977 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gjb2Q00977 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gjb2Q00977 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gjb2Q00977 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gjb2Q00977 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gjb2Q00977 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gjb2Q00977 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gjb2Q00977 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gjb2Q00977 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gjb2Q00977 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gjb2Q00977 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gjb2Q00977 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gjb2Q00977 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gjb2Q00977 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gjb2Q00977 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gjb2Q00977 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gjb2Q00977 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gjb2Q00977 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gjb2Q00977 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gjb2Q00977 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gjb2Q00977 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gjb2Q00977 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gjb2Q00977 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gjb2Q00977 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gjb2Q00977 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gjb2Q00977 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gjb2Q00977 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gjb2Q00977 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gjb2Q00977 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Gjb2Q00977 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gjb2Q00977 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gjb2Q00977 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gjb2Q00977 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gjb2Q00977 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gjb2Q00977 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gjb2Q00977 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gjb2Q00977 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gjb2Q00977 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gjb2Q00977 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gjb2Q00977 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gjb2Q00977 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gjb2Q00977 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gjb2Q00977 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gjb2Q00977 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gjb2Q00977 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gjb2Q00977 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gjb2Q00977 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gjb2Q00977 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms