Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VegfaQ00731 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VegfaQ00731 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VegfaQ00731 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VegfaQ00731 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VegfaQ00731 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VegfaQ00731 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VegfaQ00731 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VegfaQ00731 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VegfaQ00731 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VegfaQ00731 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VegfaQ00731 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VegfaQ00731 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VegfaQ00731 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VegfaQ00731 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VegfaQ00731 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VegfaQ00731 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VegfaQ00731 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
VegfaQ00731 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VegfaQ00731 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VegfaQ00731 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VegfaQ00731 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VegfaQ00731 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VegfaQ00731 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VegfaQ00731 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VegfaQ00731 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VegfaQ00731 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VegfaQ00731 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VegfaQ00731 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
VegfaQ00731 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VegfaQ00731 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VegfaQ00731 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VegfaQ00731 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
VegfaQ00731 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VegfaQ00731 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VegfaQ00731 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VegfaQ00731 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VegfaQ00731 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VegfaQ00731 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VegfaQ00731 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VegfaQ00731 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VegfaQ00731 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VegfaQ00731 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VegfaQ00731 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VegfaQ00731 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VegfaQ00731 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VegfaQ00731 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VegfaQ00731 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VegfaQ00731 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VegfaQ00731 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VegfaQ00731 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VegfaQ00731 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
VegfaQ00731 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VegfaQ00731 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VegfaQ00731 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VegfaQ00731 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VegfaQ00731 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VegfaQ00731 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VegfaQ00731 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VegfaQ00731 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VegfaQ00731 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VegfaQ00731 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VegfaQ00731 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VegfaQ00731 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VegfaQ00731 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VegfaQ00731 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VegfaQ00731 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VegfaQ00731 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VegfaQ00731 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VegfaQ00731 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VegfaQ00731 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VegfaQ00731 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VegfaQ00731 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VegfaQ00731 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VegfaQ00731 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VegfaQ00731 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VegfaQ00731 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VegfaQ00731 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VegfaQ00731 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VegfaQ00731 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VegfaQ00731 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VegfaQ00731 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VegfaQ00731 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VegfaQ00731 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VegfaQ00731 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VegfaQ00731 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VegfaQ00731 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
VegfaQ00731 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VegfaQ00731 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VegfaQ00731 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VegfaQ00731 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VegfaQ00731 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VegfaQ00731 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VegfaQ00731 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VegfaQ00731 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VegfaQ00731 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VegfaQ00731 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
VegfaQ00731 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms