Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
F8a1Q00558 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
F8a1Q00558 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
F8a1Q00558 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
F8a1Q00558 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
F8a1Q00558 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
F8a1Q00558 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
F8a1Q00558 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
F8a1Q00558 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
F8a1Q00558 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
F8a1Q00558 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
F8a1Q00558 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
F8a1Q00558 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
F8a1Q00558 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
F8a1Q00558 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
F8a1Q00558 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
F8a1Q00558 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
F8a1Q00558 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
F8a1Q00558 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
F8a1Q00558 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
F8a1Q00558 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
F8a1Q00558 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
F8a1Q00558 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
F8a1Q00558 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
F8a1Q00558 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
F8a1Q00558 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
F8a1Q00558 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
F8a1Q00558 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
F8a1Q00558 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
F8a1Q00558 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms