Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Stx2Q00262 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Stx2Q00262 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Stx2Q00262 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Stx2Q00262 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Stx2Q00262 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Stx2Q00262 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Stx2Q00262 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Stx2Q00262 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Stx2Q00262 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Stx2Q00262 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Stx2Q00262 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Stx2Q00262 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Stx2Q00262 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Stx2Q00262 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Stx2Q00262 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Stx2Q00262 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Stx2Q00262 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Stx2Q00262 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Stx2Q00262 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Stx2Q00262 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Stx2Q00262 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Stx2Q00262 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Stx2Q00262 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Stx2Q00262 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Stx2Q00262 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Stx2Q00262 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Stx2Q00262 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Stx2Q00262 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Stx2Q00262 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Stx2Q00262 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Stx2Q00262 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Stx2Q00262 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Stx2Q00262 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Stx2Q00262 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Stx2Q00262 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Stx2Q00262 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Stx2Q00262 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Stx2Q00262 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Stx2Q00262 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Stx2Q00262 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Stx2Q00262 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Stx2Q00262 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Stx2Q00262 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Stx2Q00262 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Stx2Q00262 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Stx2Q00262 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Stx2Q00262 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Stx2Q00262 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Stx2Q00262 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Stx2Q00262 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Stx2Q00262 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Stx2Q00262 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Stx2Q00262 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Stx2Q00262 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Stx2Q00262 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Stx2Q00262 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Stx2Q00262 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Stx2Q00262 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Stx2Q00262 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Stx2Q00262 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Stx2Q00262 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Stx2Q00262 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Stx2Q00262 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Stx2Q00262 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Stx2Q00262 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Stx2Q00262 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Stx2Q00262 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Stx2Q00262 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Stx2Q00262 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Stx2Q00262 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Stx2Q00262 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Stx2Q00262 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Stx2Q00262 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Stx2Q00262 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Stx2Q00262 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Stx2Q00262 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Stx2Q00262 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Stx2Q00262 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Stx2Q00262 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Stx2Q00262 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Stx2Q00262 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Stx2Q00262 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Stx2Q00262 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Stx2Q00262 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Stx2Q00262 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Stx2Q00262 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Stx2Q00262 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Stx2Q00262 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Stx2Q00262 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Stx2Q00262 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Stx2Q00262 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Stx2Q00262 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Stx2Q00262 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Stx2Q00262 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Stx2Q00262 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Stx2Q00262 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Stx2Q00262 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Stx2Q00262 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Stx2Q00262 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms