Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cds1P98191 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cds1P98191 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cds1P98191 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cds1P98191 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cds1P98191 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cds1P98191 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cds1P98191 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cds1P98191 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cds1P98191 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cds1P98191 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cds1P98191 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cds1P98191 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cds1P98191 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cds1P98191 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cds1P98191 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cds1P98191 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cds1P98191 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cds1P98191 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cds1P98191 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cds1P98191 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cds1P98191 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cds1P98191 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cds1P98191 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cds1P98191 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cds1P98191 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cds1P98191 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cds1P98191 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cds1P98191 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cds1P98191 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cds1P98191 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cds1P98191 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cds1P98191 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cds1P98191 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cds1P98191 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cds1P98191 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cds1P98191 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cds1P98191 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cds1P98191 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cds1P98191 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cds1P98191 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cds1P98191 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cds1P98191 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cds1P98191 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Cds1P98191 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cds1P98191 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cds1P98191 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cds1P98191 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cds1P98191 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cds1P98191 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cds1P98191 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cds1P98191 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cds1P98191 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cds1P98191 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cds1P98191 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cds1P98191 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cds1P98191 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cds1P98191 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cds1P98191 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cds1P98191 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cds1P98191 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cds1P98191 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cds1P98191 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cds1P98191 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cds1P98191 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cds1P98191 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cds1P98191 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cds1P98191 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cds1P98191 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cds1P98191 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cds1P98191 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cds1P98191 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cds1P98191 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cds1P98191 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cds1P98191 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cds1P98191 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cds1P98191 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cds1P98191 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cds1P98191 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cds1P98191 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cds1P98191 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cds1P98191 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cds1P98191 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cds1P98191 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cds1P98191 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cds1P98191 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cds1P98191 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cds1P98191 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cds1P98191 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cds1P98191 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cds1P98191 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cds1P98191 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cds1P98191 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cds1P98191 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cds1P98191 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cds1P98191 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cds1P98191 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cds1P98191 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cds1P98191 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cds1P98191 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms