Protein–RNA interactions for Protein: P98084

Apba2, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 2, mousemouse

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba2P98084 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Apba2P98084 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Apba2P98084 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Apba2P98084 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Apba2P98084 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Apba2P98084 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Apba2P98084 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Apba2P98084 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Apba2P98084 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Apba2P98084 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Apba2P98084 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Apba2P98084 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Apba2P98084 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Apba2P98084 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Apba2P98084 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Apba2P98084 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Apba2P98084 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Apba2P98084 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Apba2P98084 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Apba2P98084 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Apba2P98084 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Apba2P98084 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Apba2P98084 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Apba2P98084 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Apba2P98084 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Apba2P98084 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Apba2P98084 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Apba2P98084 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Apba2P98084 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Apba2P98084 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Apba2P98084 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Apba2P98084 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Apba2P98084 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Apba2P98084 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Apba2P98084 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
Apba2P98084 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Apba2P98084 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Apba2P98084 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Apba2P98084 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Apba2P98084 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Apba2P98084 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Apba2P98084 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Apba2P98084 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Apba2P98084 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Apba2P98084 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Apba2P98084 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Apba2P98084 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Apba2P98084 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Apba2P98084 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Apba2P98084 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Apba2P98084 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Apba2P98084 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Apba2P98084 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Apba2P98084 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Apba2P98084 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Apba2P98084 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Apba2P98084 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Apba2P98084 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Apba2P98084 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Apba2P98084 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Apba2P98084 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Apba2P98084 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Apba2P98084 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Apba2P98084 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Apba2P98084 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Apba2P98084 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Apba2P98084 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Apba2P98084 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Apba2P98084 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Apba2P98084 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Apba2P98084 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Apba2P98084 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Apba2P98084 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Apba2P98084 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Apba2P98084 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Apba2P98084 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Apba2P98084 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Apba2P98084 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Apba2P98084 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Apba2P98084 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Apba2P98084 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Apba2P98084 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Apba2P98084 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Apba2P98084 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Apba2P98084 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Apba2P98084 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Apba2P98084 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Apba2P98084 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Apba2P98084 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Apba2P98084 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Apba2P98084 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Apba2P98084 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Apba2P98084 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Apba2P98084 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Apba2P98084 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Apba2P98084 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Apba2P98084 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Apba2P98084 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Apba2P98084 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Apba2P98084 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms