Protein–RNA interactions for Protein: P97868

Rbbp6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp6P97868 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Rbbp6P97868 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rbbp6P97868 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rbbp6P97868 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rbbp6P97868 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Rbbp6P97868 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rbbp6P97868 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rbbp6P97868 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Rbbp6P97868 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbbp6P97868 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbbp6P97868 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbbp6P97868 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbbp6P97868 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbbp6P97868 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbbp6P97868 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbbp6P97868 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbbp6P97868 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rbbp6P97868 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbbp6P97868 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbbp6P97868 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbbp6P97868 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbbp6P97868 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbbp6P97868 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbbp6P97868 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbbp6P97868 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbbp6P97868 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbbp6P97868 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbbp6P97868 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rbbp6P97868 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbbp6P97868 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbbp6P97868 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbbp6P97868 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbbp6P97868 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbbp6P97868 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbbp6P97868 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbbp6P97868 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rbbp6P97868 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbbp6P97868 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbbp6P97868 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbbp6P97868 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbbp6P97868 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbbp6P97868 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbbp6P97868 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rbbp6P97868 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rbbp6P97868 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rbbp6P97868 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rbbp6P97868 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rbbp6P97868 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rbbp6P97868 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rbbp6P97868 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Rbbp6P97868 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rbbp6P97868 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rbbp6P97868 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rbbp6P97868 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rbbp6P97868 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rbbp6P97868 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rbbp6P97868 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rbbp6P97868 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rbbp6P97868 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rbbp6P97868 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rbbp6P97868 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rbbp6P97868 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rbbp6P97868 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rbbp6P97868 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rbbp6P97868 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rbbp6P97868 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rbbp6P97868 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rbbp6P97868 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rbbp6P97868 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rbbp6P97868 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rbbp6P97868 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rbbp6P97868 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rbbp6P97868 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rbbp6P97868 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rbbp6P97868 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rbbp6P97868 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rbbp6P97868 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rbbp6P97868 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rbbp6P97868 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rbbp6P97868 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rbbp6P97868 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rbbp6P97868 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rbbp6P97868 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rbbp6P97868 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rbbp6P97868 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rbbp6P97868 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rbbp6P97868 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rbbp6P97868 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rbbp6P97868 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rbbp6P97868 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rbbp6P97868 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rbbp6P97868 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rbbp6P97868 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rbbp6P97868 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rbbp6P97868 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rbbp6P97868 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbbp6P97868 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbbp6P97868 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbbp6P97868 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rbbp6P97868 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms