Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Smarcc1P97496 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Smarcc1P97496 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smarcc1P97496 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smarcc1P97496 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarcc1P97496 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarcc1P97496 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarcc1P97496 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarcc1P97496 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarcc1P97496 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarcc1P97496 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarcc1P97496 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarcc1P97496 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarcc1P97496 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarcc1P97496 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarcc1P97496 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarcc1P97496 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarcc1P97496 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarcc1P97496 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarcc1P97496 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarcc1P97496 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarcc1P97496 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarcc1P97496 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarcc1P97496 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarcc1P97496 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smarcc1P97496 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smarcc1P97496 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smarcc1P97496 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smarcc1P97496 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smarcc1P97496 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smarcc1P97496 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smarcc1P97496 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smarcc1P97496 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarcc1P97496 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarcc1P97496 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarcc1P97496 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarcc1P97496 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarcc1P97496 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarcc1P97496 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarcc1P97496 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarcc1P97496 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarcc1P97496 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarcc1P97496 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smarcc1P97496 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarcc1P97496 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarcc1P97496 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarcc1P97496 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarcc1P97496 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarcc1P97496 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarcc1P97496 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarcc1P97496 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarcc1P97496 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarcc1P97496 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarcc1P97496 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarcc1P97496 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarcc1P97496 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarcc1P97496 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarcc1P97496 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarcc1P97496 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarcc1P97496 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarcc1P97496 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarcc1P97496 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarcc1P97496 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smarcc1P97496 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarcc1P97496 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarcc1P97496 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarcc1P97496 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarcc1P97496 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarcc1P97496 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarcc1P97496 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smarcc1P97496 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smarcc1P97496 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smarcc1P97496 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smarcc1P97496 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smarcc1P97496 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smarcc1P97496 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smarcc1P97496 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smarcc1P97496 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smarcc1P97496 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smarcc1P97496 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Smarcc1P97496 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smarcc1P97496 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smarcc1P97496 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Smarcc1P97496 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Smarcc1P97496 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Smarcc1P97496 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Smarcc1P97496 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Smarcc1P97496 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarcc1P97496 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarcc1P97496 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarcc1P97496 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarcc1P97496 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarcc1P97496 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarcc1P97496 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarcc1P97496 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarcc1P97496 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarcc1P97496 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarcc1P97496 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarcc1P97496 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarcc1P97496 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms