Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pitx2P97474 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pitx2P97474 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pitx2P97474 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.6 ms