Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nbr1P97432 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nbr1P97432 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nbr1P97432 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nbr1P97432 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nbr1P97432 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nbr1P97432 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Nbr1P97432 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nbr1P97432 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nbr1P97432 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nbr1P97432 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nbr1P97432 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nbr1P97432 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nbr1P97432 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nbr1P97432 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nbr1P97432 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nbr1P97432 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nbr1P97432 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nbr1P97432 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nbr1P97432 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Nbr1P97432 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Nbr1P97432 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nbr1P97432 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nbr1P97432 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nbr1P97432 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nbr1P97432 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nbr1P97432 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nbr1P97432 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nbr1P97432 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nbr1P97432 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nbr1P97432 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nbr1P97432 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nbr1P97432 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nbr1P97432 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms