Protein–RNA interactions for Protein: P97370

Atp1b3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b3P97370 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atp1b3P97370 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp1b3P97370 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp1b3P97370 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp1b3P97370 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp1b3P97370 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp1b3P97370 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp1b3P97370 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp1b3P97370 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp1b3P97370 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp1b3P97370 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp1b3P97370 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp1b3P97370 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp1b3P97370 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp1b3P97370 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp1b3P97370 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp1b3P97370 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp1b3P97370 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp1b3P97370 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp1b3P97370 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp1b3P97370 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp1b3P97370 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp1b3P97370 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp1b3P97370 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp1b3P97370 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp1b3P97370 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp1b3P97370 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp1b3P97370 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp1b3P97370 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp1b3P97370 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp1b3P97370 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp1b3P97370 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp1b3P97370 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp1b3P97370 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp1b3P97370 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp1b3P97370 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp1b3P97370 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp1b3P97370 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp1b3P97370 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp1b3P97370 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp1b3P97370 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp1b3P97370 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp1b3P97370 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp1b3P97370 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp1b3P97370 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp1b3P97370 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp1b3P97370 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp1b3P97370 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp1b3P97370 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp1b3P97370 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp1b3P97370 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp1b3P97370 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp1b3P97370 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp1b3P97370 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp1b3P97370 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp1b3P97370 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp1b3P97370 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp1b3P97370 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp1b3P97370 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp1b3P97370 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp1b3P97370 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp1b3P97370 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp1b3P97370 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp1b3P97370 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp1b3P97370 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp1b3P97370 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp1b3P97370 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp1b3P97370 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp1b3P97370 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp1b3P97370 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp1b3P97370 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp1b3P97370 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp1b3P97370 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp1b3P97370 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp1b3P97370 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp1b3P97370 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp1b3P97370 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp1b3P97370 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp1b3P97370 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp1b3P97370 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp1b3P97370 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp1b3P97370 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp1b3P97370 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms