Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pkp1P97350 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pkp1P97350 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pkp1P97350 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pkp1P97350 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pkp1P97350 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Pkp1P97350 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pkp1P97350 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pkp1P97350 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pkp1P97350 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Pkp1P97350 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pkp1P97350 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pkp1P97350 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pkp1P97350 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pkp1P97350 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pkp1P97350 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pkp1P97350 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pkp1P97350 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pkp1P97350 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pkp1P97350 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pkp1P97350 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pkp1P97350 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pkp1P97350 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pkp1P97350 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pkp1P97350 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pkp1P97350 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pkp1P97350 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pkp1P97350 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pkp1P97350 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pkp1P97350 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pkp1P97350 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pkp1P97350 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Pkp1P97350 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pkp1P97350 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pkp1P97350 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pkp1P97350 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pkp1P97350 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pkp1P97350 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pkp1P97350 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pkp1P97350 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pkp1P97350 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pkp1P97350 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pkp1P97350 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pkp1P97350 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pkp1P97350 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pkp1P97350 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkp1P97350 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkp1P97350 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkp1P97350 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkp1P97350 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkp1P97350 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkp1P97350 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkp1P97350 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkp1P97350 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkp1P97350 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkp1P97350 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkp1P97350 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pkp1P97350 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pkp1P97350 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pkp1P97350 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pkp1P97350 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pkp1P97350 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pkp1P97350 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pkp1P97350 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pkp1P97350 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pkp1P97350 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pkp1P97350 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pkp1P97350 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Pkp1P97350 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pkp1P97350 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pkp1P97350 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pkp1P97350 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pkp1P97350 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pkp1P97350 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pkp1P97350 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pkp1P97350 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pkp1P97350 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pkp1P97350 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pkp1P97350 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pkp1P97350 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pkp1P97350 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pkp1P97350 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pkp1P97350 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pkp1P97350 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pkp1P97350 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pkp1P97350 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pkp1P97350 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pkp1P97350 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pkp1P97350 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pkp1P97350 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pkp1P97350 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pkp1P97350 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pkp1P97350 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pkp1P97350 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Pkp1P97350 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pkp1P97350 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pkp1P97350 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pkp1P97350 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Pkp1P97350 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pkp1P97350 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms