Protein–RNA interactions for Protein: P97334

Nkx2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-3P97334 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nkx2-3P97334 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nkx2-3P97334 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nkx2-3P97334 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nkx2-3P97334 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Nkx2-3P97334 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nkx2-3P97334 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nkx2-3P97334 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nkx2-3P97334 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nkx2-3P97334 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nkx2-3P97334 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nkx2-3P97334 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nkx2-3P97334 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nkx2-3P97334 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Nkx2-3P97334 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nkx2-3P97334 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nkx2-3P97334 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nkx2-3P97334 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nkx2-3P97334 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nkx2-3P97334 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nkx2-3P97334 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nkx2-3P97334 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nkx2-3P97334 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nkx2-3P97334 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nkx2-3P97334 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Nkx2-3P97334 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nkx2-3P97334 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nkx2-3P97334 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nkx2-3P97334 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Nkx2-3P97334 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nkx2-3P97334 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nkx2-3P97334 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Nkx2-3P97334 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nkx2-3P97334 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nkx2-3P97334 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nkx2-3P97334 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Nkx2-3P97334 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nkx2-3P97334 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nkx2-3P97334 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nkx2-3P97334 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nkx2-3P97334 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nkx2-3P97334 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nkx2-3P97334 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Nkx2-3P97334 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Nkx2-3P97334 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nkx2-3P97334 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nkx2-3P97334 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nkx2-3P97334 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nkx2-3P97334 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nkx2-3P97334 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nkx2-3P97334 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Nkx2-3P97334 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nkx2-3P97334 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nkx2-3P97334 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nkx2-3P97334 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nkx2-3P97334 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nkx2-3P97334 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nkx2-3P97334 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nkx2-3P97334 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nkx2-3P97334 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nkx2-3P97334 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nkx2-3P97334 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nkx2-3P97334 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nkx2-3P97334 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nkx2-3P97334 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Nkx2-3P97334 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nkx2-3P97334 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nkx2-3P97334 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nkx2-3P97334 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nkx2-3P97334 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nkx2-3P97334 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nkx2-3P97334 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nkx2-3P97334 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nkx2-3P97334 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nkx2-3P97334 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nkx2-3P97334 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nkx2-3P97334 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nkx2-3P97334 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nkx2-3P97334 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nkx2-3P97334 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nkx2-3P97334 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Nkx2-3P97334 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nkx2-3P97334 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nkx2-3P97334 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nkx2-3P97334 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nkx2-3P97334 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Nkx2-3P97334 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nkx2-3P97334 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nkx2-3P97334 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nkx2-3P97334 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nkx2-3P97334 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nkx2-3P97334 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nkx2-3P97334 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nkx2-3P97334 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nkx2-3P97334 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nkx2-3P97334 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nkx2-3P97334 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nkx2-3P97334 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nkx2-3P97334 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nkx2-3P97334 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms