Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mesp1P97309 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mesp1P97309 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mesp1P97309 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms