Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vgll3P85442 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vgll3P85442 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms