Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otx2P80206 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otx2P80206 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otx2P80206 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Otx2P80206 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Otx2P80206 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otx2P80206 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otx2P80206 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otx2P80206 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otx2P80206 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Otx2P80206 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otx2P80206 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otx2P80206 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otx2P80206 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otx2P80206 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otx2P80206 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otx2P80206 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otx2P80206 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otx2P80206 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otx2P80206 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otx2P80206 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otx2P80206 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otx2P80206 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otx2P80206 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otx2P80206 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otx2P80206 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otx2P80206 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otx2P80206 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otx2P80206 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otx2P80206 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otx2P80206 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otx2P80206 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otx2P80206 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otx2P80206 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otx2P80206 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Otx2P80206 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Otx2P80206 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otx2P80206 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otx2P80206 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Otx2P80206 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otx2P80206 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otx2P80206 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otx2P80206 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms