Protein–RNA interactions for Protein: P79568

H2-Q6, Class Ib MHC antigen Qa-2, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q6P79568 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-Q6P79568 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-Q6P79568 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-Q6P79568 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-Q6P79568 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-Q6P79568 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-Q6P79568 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-Q6P79568 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-Q6P79568 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-Q6P79568 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-Q6P79568 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-Q6P79568 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-Q6P79568 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-Q6P79568 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-Q6P79568 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-Q6P79568 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-Q6P79568 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-Q6P79568 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-Q6P79568 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-Q6P79568 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-Q6P79568 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-Q6P79568 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-Q6P79568 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-Q6P79568 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-Q6P79568 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-Q6P79568 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-Q6P79568 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-Q6P79568 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-Q6P79568 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-Q6P79568 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-Q6P79568 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-Q6P79568 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-Q6P79568 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-Q6P79568 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-Q6P79568 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-Q6P79568 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-Q6P79568 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-Q6P79568 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-Q6P79568 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-Q6P79568 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-Q6P79568 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-Q6P79568 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-Q6P79568 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-Q6P79568 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-Q6P79568 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-Q6P79568 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-Q6P79568 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-Q6P79568 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-Q6P79568 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-Q6P79568 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-Q6P79568 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-Q6P79568 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-Q6P79568 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-Q6P79568 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-Q6P79568 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-Q6P79568 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-Q6P79568 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-Q6P79568 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-Q6P79568 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-Q6P79568 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-Q6P79568 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms