Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smad1P70340 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smad1P70340 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smad1P70340 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smad1P70340 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smad1P70340 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smad1P70340 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smad1P70340 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smad1P70340 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms