Protein–RNA interactions for Protein: P70289

Ptprv, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase V, mousemouse

Predictions only

Length 1,705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprvP70289 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtprvP70289 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtprvP70289 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtprvP70289 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtprvP70289 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PtprvP70289 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtprvP70289 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtprvP70289 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PtprvP70289 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtprvP70289 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtprvP70289 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtprvP70289 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PtprvP70289 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtprvP70289 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtprvP70289 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtprvP70289 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtprvP70289 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PtprvP70289 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PtprvP70289 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtprvP70289 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtprvP70289 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtprvP70289 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtprvP70289 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtprvP70289 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtprvP70289 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PtprvP70289 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PtprvP70289 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PtprvP70289 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PtprvP70289 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtprvP70289 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtprvP70289 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtprvP70289 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtprvP70289 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtprvP70289 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PtprvP70289 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PtprvP70289 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PtprvP70289 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PtprvP70289 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PtprvP70289 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PtprvP70289 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PtprvP70289 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PtprvP70289 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PtprvP70289 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PtprvP70289 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PtprvP70289 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PtprvP70289 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PtprvP70289 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PtprvP70289 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PtprvP70289 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PtprvP70289 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PtprvP70289 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PtprvP70289 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PtprvP70289 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PtprvP70289 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PtprvP70289 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PtprvP70289 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PtprvP70289 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PtprvP70289 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PtprvP70289 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PtprvP70289 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PtprvP70289 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PtprvP70289 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PtprvP70289 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PtprvP70289 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PtprvP70289 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PtprvP70289 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PtprvP70289 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PtprvP70289 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PtprvP70289 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PtprvP70289 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PtprvP70289 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PtprvP70289 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PtprvP70289 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PtprvP70289 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PtprvP70289 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PtprvP70289 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PtprvP70289 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PtprvP70289 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PtprvP70289 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PtprvP70289 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PtprvP70289 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PtprvP70289 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PtprvP70289 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PtprvP70289 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PtprvP70289 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PtprvP70289 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PtprvP70289 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PtprvP70289 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PtprvP70289 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PtprvP70289 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PtprvP70289 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PtprvP70289 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PtprvP70289 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PtprvP70289 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PtprvP70289 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PtprvP70289 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PtprvP70289 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PtprvP70289 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PtprvP70289 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PtprvP70289 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms