Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sycp3P70281 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sycp3P70281 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sycp3P70281 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sycp3P70281 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sycp3P70281 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sycp3P70281 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sycp3P70281 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sycp3P70281 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sycp3P70281 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sycp3P70281 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sycp3P70281 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sycp3P70281 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Sycp3P70281 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sycp3P70281 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sycp3P70281 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sycp3P70281 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sycp3P70281 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sycp3P70281 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sycp3P70281 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sycp3P70281 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sycp3P70281 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sycp3P70281 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sycp3P70281 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sycp3P70281 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sycp3P70281 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sycp3P70281 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sycp3P70281 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sycp3P70281 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sycp3P70281 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sycp3P70281 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sycp3P70281 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sycp3P70281 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sycp3P70281 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sycp3P70281 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sycp3P70281 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sycp3P70281 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sycp3P70281 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sycp3P70281 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sycp3P70281 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sycp3P70281 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sycp3P70281 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sycp3P70281 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sycp3P70281 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Sycp3P70281 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sycp3P70281 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sycp3P70281 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sycp3P70281 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sycp3P70281 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sycp3P70281 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sycp3P70281 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sycp3P70281 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sycp3P70281 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sycp3P70281 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sycp3P70281 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sycp3P70281 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sycp3P70281 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sycp3P70281 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sycp3P70281 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sycp3P70281 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sycp3P70281 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sycp3P70281 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sycp3P70281 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sycp3P70281 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sycp3P70281 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sycp3P70281 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sycp3P70281 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sycp3P70281 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sycp3P70281 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sycp3P70281 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sycp3P70281 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sycp3P70281 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sycp3P70281 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sycp3P70281 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sycp3P70281 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sycp3P70281 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sycp3P70281 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sycp3P70281 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sycp3P70281 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sycp3P70281 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sycp3P70281 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sycp3P70281 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sycp3P70281 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sycp3P70281 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sycp3P70281 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sycp3P70281 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sycp3P70281 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sycp3P70281 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sycp3P70281 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sycp3P70281 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sycp3P70281 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sycp3P70281 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sycp3P70281 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sycp3P70281 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sycp3P70281 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sycp3P70281 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sycp3P70281 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sycp3P70281 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sycp3P70281 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms