Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rad54lP70270 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rad54lP70270 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rad54lP70270 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rad54lP70270 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rad54lP70270 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rad54lP70270 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rad54lP70270 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rad54lP70270 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rad54lP70270 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rad54lP70270 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rad54lP70270 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rad54lP70270 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rad54lP70270 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rad54lP70270 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rad54lP70270 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rad54lP70270 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rad54lP70270 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rad54lP70270 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rad54lP70270 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rad54lP70270 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Rad54lP70270 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rad54lP70270 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rad54lP70270 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Rad54lP70270 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rad54lP70270 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rad54lP70270 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rad54lP70270 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rad54lP70270 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rad54lP70270 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rad54lP70270 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rad54lP70270 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rad54lP70270 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rad54lP70270 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rad54lP70270 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rad54lP70270 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rad54lP70270 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rad54lP70270 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rad54lP70270 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rad54lP70270 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rad54lP70270 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rad54lP70270 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rad54lP70270 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rad54lP70270 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rad54lP70270 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Rad54lP70270 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rad54lP70270 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Rad54lP70270 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Rad54lP70270 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rad54lP70270 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rad54lP70270 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rad54lP70270 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rad54lP70270 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rad54lP70270 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rad54lP70270 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rad54lP70270 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rad54lP70270 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Rad54lP70270 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Rad54lP70270 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Rad54lP70270 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rad54lP70270 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rad54lP70270 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rad54lP70270 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rad54lP70270 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rad54lP70270 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rad54lP70270 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rad54lP70270 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rad54lP70270 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rad54lP70270 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rad54lP70270 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rad54lP70270 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rad54lP70270 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rad54lP70270 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rad54lP70270 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rad54lP70270 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rad54lP70270 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rad54lP70270 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rad54lP70270 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rad54lP70270 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rad54lP70270 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rad54lP70270 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rad54lP70270 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rad54lP70270 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rad54lP70270 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rad54lP70270 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rad54lP70270 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rad54lP70270 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rad54lP70270 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rad54lP70270 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Rad54lP70270 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rad54lP70270 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rad54lP70270 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rad54lP70270 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rad54lP70270 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rad54lP70270 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rad54lP70270 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rad54lP70270 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rad54lP70270 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rad54lP70270 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rad54lP70270 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms