Protein–RNA interactions for Protein: P62821

Rab1A, Ras-related protein Rab-1A, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1AP62821 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab1AP62821 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab1AP62821 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rab1AP62821 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab1AP62821 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab1AP62821 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab1AP62821 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab1AP62821 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab1AP62821 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab1AP62821 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab1AP62821 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab1AP62821 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab1AP62821 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab1AP62821 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab1AP62821 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 490.8 ms