Protein–RNA interactions for Protein: P62340

Tbpl1, TATA box-binding protein-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbpl1P62340 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tbpl1P62340 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tbpl1P62340 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tbpl1P62340 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tbpl1P62340 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tbpl1P62340 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tbpl1P62340 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tbpl1P62340 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tbpl1P62340 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tbpl1P62340 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tbpl1P62340 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tbpl1P62340 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tbpl1P62340 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tbpl1P62340 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tbpl1P62340 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tbpl1P62340 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tbpl1P62340 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tbpl1P62340 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tbpl1P62340 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tbpl1P62340 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tbpl1P62340 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tbpl1P62340 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tbpl1P62340 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tbpl1P62340 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tbpl1P62340 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tbpl1P62340 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tbpl1P62340 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tbpl1P62340 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tbpl1P62340 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tbpl1P62340 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tbpl1P62340 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tbpl1P62340 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tbpl1P62340 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tbpl1P62340 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tbpl1P62340 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tbpl1P62340 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tbpl1P62340 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tbpl1P62340 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tbpl1P62340 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tbpl1P62340 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tbpl1P62340 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Tbpl1P62340 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tbpl1P62340 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms