Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga11P61622 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga11P61622 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga11P61622 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga11P61622 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga11P61622 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Itga11P61622 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Itga11P61622 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Itga11P61622 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Itga11P61622 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Itga11P61622 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Itga11P61622 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itga11P61622 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itga11P61622 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itga11P61622 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Itga11P61622 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itga11P61622 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itga11P61622 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itga11P61622 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms