Protein–RNA interactions for Protein: P59110

Senp1, Sentrin-specific protease 1, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp1P59110 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Senp1P59110 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Senp1P59110 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Senp1P59110 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Senp1P59110 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Senp1P59110 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Senp1P59110 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Senp1P59110 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Senp1P59110 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Senp1P59110 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Senp1P59110 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Senp1P59110 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Senp1P59110 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Senp1P59110 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Senp1P59110 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Senp1P59110 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Senp1P59110 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Senp1P59110 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Senp1P59110 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Senp1P59110 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Senp1P59110 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Senp1P59110 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Senp1P59110 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Senp1P59110 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Senp1P59110 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Senp1P59110 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Senp1P59110 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Senp1P59110 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Senp1P59110 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Senp1P59110 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Senp1P59110 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Senp1P59110 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Senp1P59110 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Senp1P59110 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Senp1P59110 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Senp1P59110 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Senp1P59110 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Senp1P59110 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Senp1P59110 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Senp1P59110 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Senp1P59110 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Senp1P59110 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Senp1P59110 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Senp1P59110 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Senp1P59110 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Senp1P59110 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Senp1P59110 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Senp1P59110 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Senp1P59110 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Senp1P59110 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Senp1P59110 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Senp1P59110 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Senp1P59110 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Senp1P59110 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Senp1P59110 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Senp1P59110 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Senp1P59110 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Senp1P59110 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Senp1P59110 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Senp1P59110 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Senp1P59110 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Senp1P59110 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Senp1P59110 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Senp1P59110 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Senp1P59110 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Senp1P59110 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Senp1P59110 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Senp1P59110 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Senp1P59110 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Senp1P59110 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Senp1P59110 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Senp1P59110 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Senp1P59110 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Senp1P59110 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Senp1P59110 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Senp1P59110 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Senp1P59110 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Senp1P59110 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Senp1P59110 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Senp1P59110 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Senp1P59110 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Senp1P59110 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Senp1P59110 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Senp1P59110 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Senp1P59110 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Senp1P59110 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Senp1P59110 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Senp1P59110 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Senp1P59110 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Senp1P59110 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Senp1P59110 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Senp1P59110 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Senp1P59110 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Senp1P59110 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Senp1P59110 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Senp1P59110 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Senp1P59110 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Senp1P59110 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Senp1P59110 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Senp1P59110 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms