Protein–RNA interactions for Protein: P58749

Tm6sf1, Transmembrane 6 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm6sf1P58749 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tm6sf1P58749 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tm6sf1P58749 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tm6sf1P58749 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tm6sf1P58749 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tm6sf1P58749 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tm6sf1P58749 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tm6sf1P58749 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tm6sf1P58749 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tm6sf1P58749 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tm6sf1P58749 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tm6sf1P58749 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tm6sf1P58749 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tm6sf1P58749 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tm6sf1P58749 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tm6sf1P58749 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tm6sf1P58749 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tm6sf1P58749 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tm6sf1P58749 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tm6sf1P58749 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tm6sf1P58749 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tm6sf1P58749 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tm6sf1P58749 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tm6sf1P58749 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tm6sf1P58749 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tm6sf1P58749 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tm6sf1P58749 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tm6sf1P58749 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tm6sf1P58749 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tm6sf1P58749 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tm6sf1P58749 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tm6sf1P58749 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tm6sf1P58749 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tm6sf1P58749 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tm6sf1P58749 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tm6sf1P58749 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tm6sf1P58749 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tm6sf1P58749 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Tm6sf1P58749 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tm6sf1P58749 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tm6sf1P58749 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tm6sf1P58749 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tm6sf1P58749 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tm6sf1P58749 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tm6sf1P58749 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tm6sf1P58749 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Tm6sf1P58749 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tm6sf1P58749 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tm6sf1P58749 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tm6sf1P58749 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tm6sf1P58749 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tm6sf1P58749 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tm6sf1P58749 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tm6sf1P58749 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tm6sf1P58749 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Tm6sf1P58749 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tm6sf1P58749 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tm6sf1P58749 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tm6sf1P58749 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tm6sf1P58749 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tm6sf1P58749 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tm6sf1P58749 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tm6sf1P58749 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tm6sf1P58749 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tm6sf1P58749 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tm6sf1P58749 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tm6sf1P58749 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tm6sf1P58749 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tm6sf1P58749 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tm6sf1P58749 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tm6sf1P58749 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tm6sf1P58749 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tm6sf1P58749 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tm6sf1P58749 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tm6sf1P58749 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tm6sf1P58749 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tm6sf1P58749 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tm6sf1P58749 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tm6sf1P58749 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tm6sf1P58749 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tm6sf1P58749 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tm6sf1P58749 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tm6sf1P58749 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tm6sf1P58749 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tm6sf1P58749 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tm6sf1P58749 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tm6sf1P58749 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tm6sf1P58749 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tm6sf1P58749 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tm6sf1P58749 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tm6sf1P58749 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tm6sf1P58749 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Tm6sf1P58749 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Tm6sf1P58749 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tm6sf1P58749 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tm6sf1P58749 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tm6sf1P58749 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tm6sf1P58749 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tm6sf1P58749 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tm6sf1P58749 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms