Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
P58686 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P58686 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P58686 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P58686 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P58686 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P58686 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P58686 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P58686 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P58686 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P58686 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P58686 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P58686 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P58686 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
P58686 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P58686 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P58686 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P58686 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P58686 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P58686 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P58686 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P58686 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P58686 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P58686 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P58686 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P58686 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P58686 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P58686 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P58686 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P58686 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P58686 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P58686 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P58686 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P58686 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P58686 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P58686 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P58686 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P58686 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P58686 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P58686 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
P58686 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P58686 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P58686 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P58686 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P58686 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P58686 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P58686 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P58686 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P58686 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P58686 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P58686 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P58686 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P58686 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P58686 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P58686 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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P58686 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P58686 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P58686 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P58686 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P58686 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
P58686 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P58686 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P58686 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P58686 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P58686 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P58686 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P58686 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P58686 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P58686 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P58686 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P58686 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P58686 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P58686 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P58686 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P58686 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P58686 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P58686 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P58686 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P58686 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P58686 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P58686 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P58686 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P58686 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P58686 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P58686 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P58686 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P58686 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P58686 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P58686 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P58686 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P58686 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P58686 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P58686 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P58686 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P58686 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
P58686 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P58686 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms