Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Strn4P58404 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Strn4P58404 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Strn4P58404 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Strn4P58404 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Strn4P58404 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Strn4P58404 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Strn4P58404 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Strn4P58404 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Strn4P58404 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Strn4P58404 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Strn4P58404 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Strn4P58404 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Strn4P58404 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Strn4P58404 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Strn4P58404 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Strn4P58404 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Strn4P58404 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Strn4P58404 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Strn4P58404 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Strn4P58404 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Strn4P58404 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Strn4P58404 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Strn4P58404 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Strn4P58404 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Strn4P58404 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Strn4P58404 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Strn4P58404 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Strn4P58404 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Strn4P58404 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Strn4P58404 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Strn4P58404 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Strn4P58404 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Strn4P58404 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Strn4P58404 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Strn4P58404 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Strn4P58404 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Strn4P58404 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Strn4P58404 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Strn4P58404 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Strn4P58404 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Strn4P58404 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Strn4P58404 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Strn4P58404 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Strn4P58404 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Strn4P58404 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Strn4P58404 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Strn4P58404 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Strn4P58404 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Strn4P58404 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Strn4P58404 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Strn4P58404 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Strn4P58404 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Strn4P58404 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Strn4P58404 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Strn4P58404 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Strn4P58404 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Strn4P58404 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Strn4P58404 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Strn4P58404 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Strn4P58404 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Strn4P58404 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Strn4P58404 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Strn4P58404 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Strn4P58404 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Strn4P58404 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Strn4P58404 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Strn4P58404 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Strn4P58404 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Strn4P58404 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Strn4P58404 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Strn4P58404 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Strn4P58404 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Strn4P58404 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Strn4P58404 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Strn4P58404 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Strn4P58404 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Strn4P58404 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Strn4P58404 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Strn4P58404 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Strn4P58404 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Strn4P58404 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Strn4P58404 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Strn4P58404 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Strn4P58404 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Strn4P58404 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Strn4P58404 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Strn4P58404 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Strn4P58404 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Strn4P58404 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Strn4P58404 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Strn4P58404 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Strn4P58404 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Strn4P58404 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Strn4P58404 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Strn4P58404 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Strn4P58404 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Strn4P58404 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Strn4P58404 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Strn4P58404 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms