Protein–RNA interactions for Protein: P58389

Ptpa, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpaP58389 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtpaP58389 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtpaP58389 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtpaP58389 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtpaP58389 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtpaP58389 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtpaP58389 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtpaP58389 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtpaP58389 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtpaP58389 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PtpaP58389 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtpaP58389 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtpaP58389 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PtpaP58389 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PtpaP58389 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtpaP58389 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PtpaP58389 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtpaP58389 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtpaP58389 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtpaP58389 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtpaP58389 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtpaP58389 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtpaP58389 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtpaP58389 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PtpaP58389 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtpaP58389 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PtpaP58389 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtpaP58389 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtpaP58389 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtpaP58389 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtpaP58389 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PtpaP58389 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtpaP58389 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtpaP58389 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PtpaP58389 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtpaP58389 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtpaP58389 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtpaP58389 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtpaP58389 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtpaP58389 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtpaP58389 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtpaP58389 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtpaP58389 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PtpaP58389 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtpaP58389 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtpaP58389 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtpaP58389 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtpaP58389 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtpaP58389 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtpaP58389 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtpaP58389 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtpaP58389 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtpaP58389 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PtpaP58389 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtpaP58389 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtpaP58389 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtpaP58389 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtpaP58389 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtpaP58389 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtpaP58389 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtpaP58389 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PtpaP58389 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtpaP58389 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtpaP58389 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtpaP58389 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtpaP58389 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtpaP58389 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtpaP58389 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtpaP58389 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtpaP58389 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtpaP58389 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtpaP58389 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtpaP58389 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtpaP58389 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtpaP58389 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtpaP58389 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtpaP58389 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtpaP58389 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtpaP58389 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtpaP58389 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtpaP58389 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtpaP58389 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtpaP58389 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PtpaP58389 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtpaP58389 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtpaP58389 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtpaP58389 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtpaP58389 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtpaP58389 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtpaP58389 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PtpaP58389 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtpaP58389 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtpaP58389 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtpaP58389 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtpaP58389 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtpaP58389 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtpaP58389 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtpaP58389 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtpaP58389 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtpaP58389 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms