Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Smpdl3bP58242 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smpdl3bP58242 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smpdl3bP58242 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smpdl3bP58242 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smpdl3bP58242 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Smpdl3bP58242 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Smpdl3bP58242 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smpdl3bP58242 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smpdl3bP58242 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smpdl3bP58242 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smpdl3bP58242 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smpdl3bP58242 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smpdl3bP58242 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smpdl3bP58242 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smpdl3bP58242 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Smpdl3bP58242 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smpdl3bP58242 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smpdl3bP58242 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smpdl3bP58242 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smpdl3bP58242 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smpdl3bP58242 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smpdl3bP58242 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smpdl3bP58242 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smpdl3bP58242 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smpdl3bP58242 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smpdl3bP58242 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smpdl3bP58242 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smpdl3bP58242 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smpdl3bP58242 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Smpdl3bP58242 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Smpdl3bP58242 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms