Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp25P57080 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp25P57080 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp25P57080 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp25P57080 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp25P57080 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp25P57080 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp25P57080 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp25P57080 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp25P57080 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp25P57080 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp25P57080 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp25P57080 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp25P57080 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp25P57080 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp25P57080 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp25P57080 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp25P57080 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp25P57080 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp25P57080 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp25P57080 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp25P57080 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp25P57080 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp25P57080 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp25P57080 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp25P57080 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp25P57080 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp25P57080 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp25P57080 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp25P57080 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp25P57080 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp25P57080 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp25P57080 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp25P57080 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp25P57080 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp25P57080 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp25P57080 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp25P57080 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp25P57080 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp25P57080 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms