Protein–RNA interactions for Protein: P56959

Fus, RNA-binding protein FUS, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FusP56959 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FusP56959 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FusP56959 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FusP56959 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FusP56959 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FusP56959 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FusP56959 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FusP56959 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FusP56959 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FusP56959 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FusP56959 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FusP56959 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FusP56959 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FusP56959 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FusP56959 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FusP56959 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FusP56959 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FusP56959 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FusP56959 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FusP56959 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FusP56959 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FusP56959 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FusP56959 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FusP56959 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FusP56959 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FusP56959 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FusP56959 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FusP56959 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FusP56959 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FusP56959 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FusP56959 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FusP56959 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FusP56959 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FusP56959 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FusP56959 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FusP56959 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FusP56959 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FusP56959 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FusP56959 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FusP56959 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FusP56959 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FusP56959 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FusP56959 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FusP56959 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FusP56959 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FusP56959 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FusP56959 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FusP56959 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FusP56959 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FusP56959 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FusP56959 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FusP56959 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FusP56959 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FusP56959 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FusP56959 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FusP56959 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FusP56959 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FusP56959 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FusP56959 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FusP56959 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FusP56959 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FusP56959 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FusP56959 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FusP56959 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FusP56959 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FusP56959 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FusP56959 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FusP56959 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FusP56959 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FusP56959 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FusP56959 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FusP56959 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FusP56959 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FusP56959 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FusP56959 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FusP56959 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FusP56959 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FusP56959 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FusP56959 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FusP56959 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FusP56959 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FusP56959 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FusP56959 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FusP56959 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FusP56959 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FusP56959 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FusP56959 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FusP56959 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FusP56959 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FusP56959 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FusP56959 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FusP56959 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FusP56959 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FusP56959 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FusP56959 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FusP56959 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FusP56959 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FusP56959 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FusP56959 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FusP56959 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms