Protein–RNA interactions for Protein: P56873

Sssca1, Sjoegren syndrome/scleroderma autoantigen 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sssca1P56873 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sssca1P56873 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sssca1P56873 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms