Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pdcd5P56812 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pdcd5P56812 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms