Protein–RNA interactions for Protein: P56657

Cyp2c40, Cytochrome P450 2C40, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c40P56657 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cyp2c40P56657 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cyp2c40P56657 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cyp2c40P56657 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cyp2c40P56657 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cyp2c40P56657 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cyp2c40P56657 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cyp2c40P56657 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cyp2c40P56657 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cyp2c40P56657 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cyp2c40P56657 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cyp2c40P56657 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cyp2c40P56657 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cyp2c40P56657 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cyp2c40P56657 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cyp2c40P56657 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cyp2c40P56657 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cyp2c40P56657 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cyp2c40P56657 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cyp2c40P56657 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cyp2c40P56657 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cyp2c40P56657 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cyp2c40P56657 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cyp2c40P56657 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cyp2c40P56657 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cyp2c40P56657 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyp2c40P56657 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyp2c40P56657 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyp2c40P56657 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyp2c40P56657 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyp2c40P56657 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyp2c40P56657 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cyp2c40P56657 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cyp2c40P56657 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cyp2c40P56657 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cyp2c40P56657 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cyp2c40P56657 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cyp2c40P56657 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cyp2c40P56657 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cyp2c40P56657 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cyp2c40P56657 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cyp2c40P56657 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cyp2c40P56657 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cyp2c40P56657 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cyp2c40P56657 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cyp2c40P56657 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cyp2c40P56657 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Cyp2c40P56657 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cyp2c40P56657 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cyp2c40P56657 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cyp2c40P56657 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cyp2c40P56657 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cyp2c40P56657 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cyp2c40P56657 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cyp2c40P56657 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cyp2c40P56657 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cyp2c40P56657 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Cyp2c40P56657 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cyp2c40P56657 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cyp2c40P56657 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cyp2c40P56657 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cyp2c40P56657 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyp2c40P56657 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyp2c40P56657 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyp2c40P56657 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyp2c40P56657 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyp2c40P56657 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyp2c40P56657 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyp2c40P56657 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyp2c40P56657 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyp2c40P56657 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyp2c40P56657 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyp2c40P56657 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyp2c40P56657 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyp2c40P56657 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyp2c40P56657 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cyp2c40P56657 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cyp2c40P56657 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cyp2c40P56657 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cyp2c40P56657 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cyp2c40P56657 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cyp2c40P56657 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cyp2c40P56657 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cyp2c40P56657 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cyp2c40P56657 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cyp2c40P56657 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cyp2c40P56657 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cyp2c40P56657 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cyp2c40P56657 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cyp2c40P56657 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cyp2c40P56657 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cyp2c40P56657 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cyp2c40P56657 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cyp2c40P56657 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cyp2c40P56657 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cyp2c40P56657 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Cyp2c40P56657 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cyp2c40P56657 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cyp2c40P56657 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cyp2c40P56657 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms