Protein–RNA interactions for Protein: P56546

Ctbp2, C-terminal-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctbp2P56546 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctbp2P56546 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ctbp2P56546 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms