Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CckbrP56481 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CckbrP56481 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CckbrP56481 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CckbrP56481 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CckbrP56481 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CckbrP56481 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CckbrP56481 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CckbrP56481 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CckbrP56481 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CckbrP56481 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CckbrP56481 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms