Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irf5P56477 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irf5P56477 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Irf5P56477 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irf5P56477 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irf5P56477 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irf5P56477 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irf5P56477 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irf5P56477 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irf5P56477 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irf5P56477 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irf5P56477 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irf5P56477 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irf5P56477 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irf5P56477 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irf5P56477 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irf5P56477 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irf5P56477 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irf5P56477 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Irf5P56477 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irf5P56477 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irf5P56477 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irf5P56477 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irf5P56477 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irf5P56477 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irf5P56477 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irf5P56477 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Irf5P56477 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irf5P56477 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irf5P56477 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irf5P56477 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irf5P56477 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irf5P56477 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irf5P56477 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irf5P56477 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irf5P56477 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irf5P56477 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irf5P56477 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irf5P56477 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Irf5P56477 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Irf5P56477 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Irf5P56477 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Irf5P56477 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Irf5P56477 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Irf5P56477 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irf5P56477 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irf5P56477 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irf5P56477 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irf5P56477 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irf5P56477 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irf5P56477 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irf5P56477 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irf5P56477 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irf5P56477 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Irf5P56477 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irf5P56477 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irf5P56477 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irf5P56477 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irf5P56477 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irf5P56477 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irf5P56477 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irf5P56477 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irf5P56477 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irf5P56477 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Irf5P56477 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irf5P56477 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irf5P56477 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irf5P56477 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irf5P56477 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irf5P56477 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irf5P56477 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irf5P56477 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irf5P56477 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irf5P56477 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irf5P56477 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irf5P56477 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irf5P56477 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irf5P56477 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irf5P56477 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irf5P56477 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irf5P56477 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irf5P56477 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irf5P56477 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irf5P56477 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irf5P56477 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irf5P56477 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irf5P56477 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irf5P56477 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irf5P56477 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Irf5P56477 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irf5P56477 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irf5P56477 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Irf5P56477 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irf5P56477 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irf5P56477 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irf5P56477 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irf5P56477 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Irf5P56477 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irf5P56477 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irf5P56477 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms