Protein–RNA interactions for Protein: P56371

Rab4a, Ras-related protein Rab-4A, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4aP56371 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab4aP56371 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab4aP56371 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms