Protein–RNA interactions for Protein: P53994

Rab2a, Ras-related protein Rab-2A, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab2aP53994 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab2aP53994 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab2aP53994 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms