Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PctpP53808 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PctpP53808 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PctpP53808 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PctpP53808 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PctpP53808 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PctpP53808 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PctpP53808 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PctpP53808 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PctpP53808 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PctpP53808 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PctpP53808 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PctpP53808 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PctpP53808 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PctpP53808 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PctpP53808 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PctpP53808 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PctpP53808 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PctpP53808 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PctpP53808 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PctpP53808 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PctpP53808 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PctpP53808 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PctpP53808 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PctpP53808 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PctpP53808 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PctpP53808 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PctpP53808 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PctpP53808 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PctpP53808 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PctpP53808 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PctpP53808 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PctpP53808 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PctpP53808 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PctpP53808 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PctpP53808 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PctpP53808 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PctpP53808 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PctpP53808 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PctpP53808 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PctpP53808 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PctpP53808 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PctpP53808 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PctpP53808 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PctpP53808 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PctpP53808 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PctpP53808 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PctpP53808 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PctpP53808 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PctpP53808 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PctpP53808 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PctpP53808 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PctpP53808 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PctpP53808 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PctpP53808 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PctpP53808 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PctpP53808 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PctpP53808 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PctpP53808 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PctpP53808 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PctpP53808 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PctpP53808 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PctpP53808 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PctpP53808 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PctpP53808 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PctpP53808 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PctpP53808 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PctpP53808 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PctpP53808 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PctpP53808 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PctpP53808 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PctpP53808 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PctpP53808 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PctpP53808 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PctpP53808 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PctpP53808 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PctpP53808 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PctpP53808 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PctpP53808 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PctpP53808 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PctpP53808 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PctpP53808 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PctpP53808 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PctpP53808 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PctpP53808 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PctpP53808 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PctpP53808 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PctpP53808 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PctpP53808 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PctpP53808 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PctpP53808 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PctpP53808 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PctpP53808 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PctpP53808 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PctpP53808 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PctpP53808 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PctpP53808 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PctpP53808 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PctpP53808 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PctpP53808 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms