Protein–RNA interactions for Protein: P52793

Efna1, Ephrin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna1P52793 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Efna1P52793 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efna1P52793 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efna1P52793 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna1P52793 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna1P52793 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efna1P52793 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efna1P52793 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms