Protein–RNA interactions for Protein: P52432

Polr1c, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1cP52432 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Polr1cP52432 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Polr1cP52432 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Polr1cP52432 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Polr1cP52432 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Polr1cP52432 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Polr1cP52432 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Polr1cP52432 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Polr1cP52432 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Polr1cP52432 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Polr1cP52432 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Polr1cP52432 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Polr1cP52432 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Polr1cP52432 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Polr1cP52432 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Polr1cP52432 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Polr1cP52432 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Polr1cP52432 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Polr1cP52432 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Polr1cP52432 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Polr1cP52432 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Polr1cP52432 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Polr1cP52432 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Polr1cP52432 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Polr1cP52432 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Polr1cP52432 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Polr1cP52432 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Polr1cP52432 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Polr1cP52432 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Polr1cP52432 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Polr1cP52432 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Polr1cP52432 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Polr1cP52432 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Polr1cP52432 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Polr1cP52432 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Polr1cP52432 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Polr1cP52432 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Polr1cP52432 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Polr1cP52432 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Polr1cP52432 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Polr1cP52432 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Polr1cP52432 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Polr1cP52432 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Polr1cP52432 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Polr1cP52432 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Polr1cP52432 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Polr1cP52432 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Polr1cP52432 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Polr1cP52432 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Polr1cP52432 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Polr1cP52432 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Polr1cP52432 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Polr1cP52432 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Polr1cP52432 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Polr1cP52432 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Polr1cP52432 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Polr1cP52432 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Polr1cP52432 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Polr1cP52432 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Polr1cP52432 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Polr1cP52432 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms